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未来实验室

未来实验室 GTX-Laboratory

BT+IT的(de)前沿科(ke)技研究中心

未来实验室是生物科技行业的前沿科技研究中心,致力于用领先科技推动生物医药行业未来十年 的迅速发展。GTX目前的在研产品包括:下一代生物信息计算平台(FPGA加速芯片)、医疗信息文本 挖掘、基因和性状关联关系知识发现等,这一系列产品的市场化将对整个行业带来巨大的变革和进步

基因超算工作站

基因超算工作站GTX.One

全基因组分析 | 全外显子分析 fairwest.net | GTX-Laboratory

GTX.One是人和(he)未(wei)来大数据(ju)部(bu)门自主研发的(de)一款面向基(ji)因(yin)(yin)行业的(de)超级计(ji)算(suan)(suan)(suan)服务器(qi)。 内置的(de)高性能基(ji)因(yin)(yin)组(zu)计(ji)算(suan)(suan)(suan)加速、基(ji)因(yin)(yin)组(zu)大数据(ju)压缩传(chuan)输、基(ji)因(yin)(yin)突变注释(shi)三大功能模块组(zu)成了GTX.One的(de)“全(quan)栈式(shi)”解(jie)决方案(an),将快速获(huo)取“数据(ju)、算(suan)(suan)(suan)力、知识(shi)”的(de)能力赋(fu)予用户。 GTX.One专注于基(ji)因(yin)(yin)组(zu)重型计(ji)算(suan)(suan)(suan)加速,采(cai)用CPU和(he)FPGA协同工(gong)作的(de)异构加速技术(shu),利用各自的(de)特性进(jin)行基(ji)因(yin)(yin)数据(ju)的(de)高性能计(ji)算(suan)(suan)(suan)。可以将30X的(de)全(quan)基(ji)因(yin)(yin)组(zu)数据(ju)分(fen)析(xi)时间从(cong)(cong)30小时缩短至30分(fen)钟(zhong);将100X全(quan)外显子数据(ju)分(fen)析(xi)时间从(cong)(cong)6小时缩短至5分(fen)钟(zhong)完(wan)成。

01. 唯快不破

加速生(sheng)物计算50-200倍(bei)

02. 成本低

1张卡相当于60台服务器

文本挖掘和知识发现

文本挖掘和知识发现 GTXdigest

基于NCBI text mining的人类CNV数据库 | 人类性状与基因型关联挖掘 fairwest.net | GTX-Laboratory

通(tong)过文(wen)(wen)(wen)本(ben)挖(wa)(wa)掘(jue)(jue)系统化理(li)解(jie)基因和(he)疾(ji)病之(zhi)间的(de)(de)关系,充(chong)分(fen)利(li)用(yong)已知(zhi)的(de)(de)所有信息(xi)提炼知(zhi)识图谱(pu)。精准医疗(liao)的(de)(de)实(shi)现有赖(lai)于对(dui)疾(ji)病分(fen)子机理(li)的(de)(de)系统化理(li)解(jie)。将(jiang)汗牛(niu)充(chong)栋(dong)的(de)(de)科(ke)学(xue)文(wen)(wen)(wen)献,利(li)用(yong)文(wen)(wen)(wen)本(ben)挖(wa)(wa)掘(jue)(jue)对(dui)相(xiang)关信息(xi)进行提取和(he)重(zhong)构,通(tong)过自(zi)动(dong)化处理(li)流程,将(jiang)人从枯燥乏味的(de)(de)数据库和(he)文(wen)(wen)(wen)献检索过程中解(jie)放出来,借助计(ji)算机快速把握已有研(yan)究成果,发现新知(zhi)识。

01. 全面覆盖

覆盖NCBI所有文献摘要

02. 精准分析

精准提取(qu)和挖掘基(ji)因与疾病之间的关系

03. 自动更新

每(mei)月更新(xin)NCBI最新(xin)文献

大数据上云工具

大数据上云工具 GTXzip

通用数据压缩打包系统丨基因测序数据 fairwest.net | GTX-Laboratory

采用(yong)先(xian)进的(de)压缩(suo)算法对(dui)任(ren)意(yi)数(shu)据或目录进行(xing)(xing)高压缩(suo)率(lv)的(de)快速打(da)包。对(dui)于基因测(ce)序Fastq数(shu)据,与行(xing)(xing)业(ye)默认标(biao)准gzip相比,以1/6的(de)时间实现了其1/4的(de)压缩(suo)大小(xiao)。在这样的(de)极高倍率(lv)压缩(suo)技(ji)术的(de)支持下,使用(yong)百兆网络,就能达到(dao)以千(qian)兆速度上传数(shu)据的(de)效果,使得大规(gui)模测(ce)序数(shu)据上云(yun)成(cheng)为(wei)可能。

01. 高压缩比

压缩率1/18(Fastq 7个质量值)压缩率1/8(Fastq 33个质量值)

02. 高性能

压缩速度高达120MB/s 支持边压缩边传输

03. All in One

支持多目录及各种文件类型 压缩打包成单个文件

04. 支持随机寻址

解压时支持“随机寻址” 可任意解压包中指定文件

高性能云计算平台

高性能云计算平台 GTXWGS

弹性计算技术丨全基因组分析 fairwest.net | GTX-Laboratory

在AWS或者阿里云等(deng)云服(fu)务上构筑(zhu)计算平(ping)台,利用先(xian)进的分布(bu)式数据(ju)存(cun)储技(ji)术跨域(yu)巨(ju)大的IO墙,将人(ren)类全基(ji)因的数据(ju)分析(从Fastq到VCF)的时(shi)间从几(ji)十(shi)个小时(shi)缩短为(wei)一杯咖啡的时(shi)间。同时(shi)支(zhi)持AWS的竞价策略,将计算费用降低为(wei)百元人(ren)民(min)币。

01. 高效率

18分钟完成400G 55x人类全基因组(zu)分析(xi)

02. 低成本

计(ji)算费用(yong)仅为百元(yuan)人民(min)币(bi)($16),分(fen)析(xi)结果准确性达(da)99.9%

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